Quatrième sanctuaire construit en ce lieu, l'église a souffert des guerres de religions. Après son pillage par les Huguenots, il a fallu la fermer au culte pendant plusieurs décennies. La reconstruction qui s'imposait en 1856 s'est accompagnée d'un agrandissement nécessaire à l'accueil d'une paroisse en pleine expansion, suivi de la pose des vitraux et la construction de la voûte. Bernard Bénézet, peintre toulousain, a été appelé pour décorer les murs du choeur, et Sicardou, sculpteur toulousain, a réalisé l'autel de marbre et d'onyx. Quand au lambris de bois qui entoure le choeur, il a été réalisé par un artisan villemurien. Le clocher, édifié en 1875, reçut alors la grosse cloche appelée "le souc" sans doute en raison de son énorme contre poids de bois. C'est la pièce la plus ancienne du monument, car elle provient de l'église précédente. Le clocher abrite aujourd'hui 3 cloches nommées "Germaine", "Monseigneur" et "Alain-Marie".
