Le site protège la vallée de la Baïse au nord et au sud de la ville de Nérac. Le périmètre couvre environ un linéaire de huit à neuf kilomètres de cours d’eau. Sur cette portion, la vallée est assez large, en moyenne 1,7 km, on remarque un resserrement au niveau de la ville de Nérac (à peine 1km). En terme de profil, le périmètre protège soit le lit mineur, soit une partie de la première terrasse, il ne s’étend jamais au delà du pied de coteau qui pourtant constitue la limite visuelle de la vallée. D’amont en aval, le périmètre du site est divisé en deux îlots, et quatre secteurs sont identifiables : le hameau de Nazareth et l’amont de la ville de Nérac agricole, la rive gauche de la Baïse en secteur urbain en amont de Nérac, les rives de la Baïse en secteur urbain en aval de Nérac et enfin, le secteur nord agricole ponctué de belles demeures.
